Антимикробный эффект Браунодина связан с выделением свободного йода при контакте с кожей, слизистой оболочкой и поверхностью раны, и зависит не от концентрации раствора повидон-йода, а от концентрации свободного йода, содержание которого в Браунодине 22 мг/л, что гораздо больше, чем у аналогичных препаратов повидон-йода. Браунодин — антибактериальное средство, к которому отсутствует резистентность болезнетворных микроорганизмов от вирусов до простейших: даже в разведении 1/2000 он разрушает все вегетативные формы бактерий. Среднее время антимикробного воздействия повидон-йода на микроорганизмы: грамположительные и грамотрицательные бактерии — 15–30 секунд; вирусы — 15 секунд; грибы — 15–30 секунд; простейшие (трихомонады) — 30–60 секунд.
Браунодин представляет собой депо йода. За счет постепенного высвобождения йода из комплекса повидон-йод действует длительно. Благодаря большому размеру комплексной молекулы, он не проникает через биологические барьеры, поэтому системное действие йода отсутствует. Браунодин за счет своего осмотического действия снимает отеки и уменьшает воспаление тканей. Проведение ирригации раневой полости водным раствором повидон-йода во время хирургической операции и перед наложением швов на операционную рану является одной из рекомендаций ВОЗ по профилактике инфекции в области хирургического вмешательства. Эти свойства делают Браунодин незаменимым местным антисептиком в неотложной хирургии.